生活在海岛的少年夏目，在一次台风过后，在海边救起了一位失去记忆的神秘女子。女子除了自己的名字“小夏”外什么都不记得，却本能地会做一手好菜和家务。夏目收留了她，两人以“夫妻”的名义开始了奇妙的生活。小夏的到来，让夏目封闭的内心逐渐打开，而小夏的真实身份，似乎与那片被台风唤醒的远古海域有关。
夏目为小夏举办了迟来的婚礼，全村人都来祝贺。当两人交换贝壳戒指时，海面泛起金光，小夏的脚踝上浮现出人鱼特有的鳞片纹路。
渔村长老告诉夏目，小夏可能是传说中“海之巫女”的后代，世世代代守护着这片海域。台风是她的召唤，而她失去了记忆，是为了体验人间情感。
外来开发商要填海造酒店，村民们陷入恐慌。小夏在夜晚独自走向大海，次日海上便掀起了巨浪，阻止了施工队的进一步行动。
夏目带着小夏去山顶看烟火，小夏第一次看到如此绚丽的景象，激动地抱住了他。夏目心跳加速，发现自己在不知不觉中已经爱上了她。
小夏用岛上的特产做出了一道道奇特的菜肴，夏目吃了后发现，每一道菜都能勾起他童年与父母的美好回忆。这让他确信，小夏绝非普通人。
台风过境，夏目在海滩捡拾贝壳时，发现了昏迷的小夏。她穿着古老的白色长裙，身上挂着刻满符文的贝壳项链。